Projekt Naravni viri kraških turističnih jam: ravnovesje med varovanjem, izkoriščanjem in promocijo Trajanje projekta: 1. januar 2016–31. december 2018 Vodja projekta: dr. Janez Mulec
Projekt Modeliranje hidrološkega odziva nehomogenih povodij Trajanje projekta: 1. januar 2016–31. december 2018 Vodja projekta: Mitja Brilly (Fakulteta za gradbeništvo in geodezijo, Univerza v Ljubljani) Šifra: J2-7322 (D)
Projekt Znanstveni temelji za varstvo človeške ribice (proteus anguinus): metodologija monitoringa, ocena izhodiščnega stanja ter identifikacija varstveno pomembnih enot Trajanje projekta: 1. oktober 2014–30. september 2017 Vodja projekta: dr. Peter Trontelj Šifra: L1-6731 (D)
Projekt Ocena vpliva naravnih in antropogenih procesov na mikrometeorologijo Postojnske jame z uporabo numeričnih modelov ter sodobnih metod zajemanja in prenosa okoljskih podatkov Trajanje projekta: 1. oktober 2014–30. september 2017 Šifra: L2-6762 (B)
Projekt Preučevanje mikrobioma kraških podzemnih voda z novejšimi pristopi v metagenomiki Trajanje projekta: 1. julij 2014–30. junij 2017 Vodja projekta: dr. Blaž Stres Šifra: J1-6741
Projekt TRANSFORM 2 Trajanje projekta: 1. december 2024–31. december 2027 Šifra: 101188365 (HORIZON-INFRA-2024-DEV-01)
Projekt EPOS ON Trajanje projekta: 1. september 2024–1. september 2027 Šifra: 101131592 (HORIZON-INFRA-2023-DEV-01-03)
Projekt Kombinirana uporaba analiz padavinskih dogodkov in sledilnih poskusov za določitev značilnosti pretoka in prenosa snovi v kraških vodonosnikih Trajanje projekta: 1. oktober 2023–30. september 2025
Projekt Upravljanje močvirskih habitatov za ohranjanje vodnih ptic presihajočih jezer Trajanje projekta: 1. september 2023–31. december 2029 Šifra: 101114184 - LIFE22-NAT-SI-LIFE TRSCA
Projekt Analiza hidrodinamike in kakovosti voda na Radenskem polju s poudarkom na razmerah na območju blizu zaselka Pirka Trajanje projekta: 21. februar 2023–22. marec 2024